O município de Amapá, do ponto de vista geográfico, situa-se na parte nordeste do Estado do Amapá, com altitude de 8,64m (sede). Distante da capital, aproximadamente 300 km, tendo como via de acesso, a marítima, aérea e terrestre, esta última mantida regularmente com linhas de empresas de ônibus.
A área do município é de 9.203,50.
Faz limite com os municípios de: Calçoene (Norte e Oeste), Pracuúba (Sul), e Oceano Atlântico (Leste)
Além da sede municipal, existem 12 núcleos populacionais consideráveis: Amapá Grande, Araquiçava, Base Aérea, Calafate, Cruzeiro, Paratu, Piquiá, Ramudo, Santo Antonio, Vista Alegre, Vulcão do Norte, Sucuriju,